Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA9P31269 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms