Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CD40LGP29965 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms