Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD38P28907 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD38P28907 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD38P28907 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD38P28907 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD38P28907 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD38P28907 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD38P28907 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD38P28907 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD38P28907 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms