Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4AP27815 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4AP27815 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4AP27815 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4AP27815 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PDE4AP27815 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms