Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD27P26842 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD27P26842 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD27P26842 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD27P26842 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD27P26842 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD27P26842 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD27P26842 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD27P26842 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms