Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	YNL057W	YNL057W	333 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YNL217W	YNL217W	981 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	FRA2	YGL220W	363 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	FMP33	YJL161W	543 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YAR023C	YAR023C	540 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YET2	YMR040W	483 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	MFA2	YNL145W	117 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	MVD1	YNR043W	1191 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	LYS5	YGL154C	819 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YGR269W	YGR269W	327 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	MIF2	YKL089W	1650 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	TFA1	YKL028W	1449 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	RNA15	YGL044C	891 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YPL071C	YPL071C	471 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.84	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	ADY3	YDL239C	2373 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YGR015C	YGR015C	987 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RFC2	YJR068W	1062 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	VTA1	YLR181C	993 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	ELO3	YLR372W	1038 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SET6	YPL165C	1122 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	PCL9	YDL179W	915 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	LPP1	YDR503C	825 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	CDC21	YOR074C	915 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RXT3	YDL076C	885 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SNL1	YIL016W	480 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RFU1	YLR073C	603 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SPO19	YPL130W	672 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YPL278C	YPL278C	303 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	PER1	YCR044C	1074 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	COS7	YDL248W	1152 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	COX18	YGR062C	951 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	COS5	YJR161C	1152 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YRA2	YKL214C	612 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	SAS4	YDR181C	1446 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	MPC54	YOR177C	1395 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	TIS11	YLR136C	858 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YMR221C	YMR221C	1515 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RMD1	YDL001W	1293 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	RAI1	YGL246C	1164 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	LTO1	YNL260C	597 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	MET4	YNL103W	2019 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	MET12	YPL023C	1974 nt		4.78	□□□□□ -1.64
RPC53	P25441	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YJR026W	YJR026W	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YJR028W	YJR028W	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YAR010C	YAR010C	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YML040W	YML040W	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65
RPC53	P25441	YMR051C	YMR051C	1323 nt		4.77	□□□□□ -1.65

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