Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 RME1YGR044C 903 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 DOG2YHR043C 741 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 DOG1YHR044C 741 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 NSE1YLR007W 1011 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 TIS11YLR136C 858 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 STM1YLR150W 822 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 PML39YML107C 1005 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MVD1YNR043W 1191 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 SPS4YOR313C 1017 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 NOP8YOL144W 1455 nt5.25□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YHR045WYHR045W 1683 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 RPS2YGL123W 765 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 EFG1YGR271C-A 702 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 EMG1YLR186W 759 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 CCS1YMR038C 750 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MGR2YPL098C 342 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YPL199CYPL199C 723 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 DIM1YPL266W 957 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YBR071WYBR071W 636 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MAL11YGR289C 1851 nt5.24□□□□□ -1.57
HCM1P25364 WTM2YOR229W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YIL001WYIL001W 1542 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 GCS1YDL226C 1059 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 RSR1YGR152C 819 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 RSM27YGR215W 333 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YJR071WYJR071W 369 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YLR339CYLR339C 552 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 CSI2YOL007C 1026 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 PNO1YOR145C 825 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MRP2YPR166C 348 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MRPL37YBR268W 318 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 BI3Q0115 1554 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 ART10YLR392C 1557 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 FET3YMR058W 1911 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 TAX4YJL083W 1815 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 BUD8YLR353W 1812 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 PHO12YHR215W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 PHO11YAR071W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 HOS1YPR068C 1413 nt5.23□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YGR111WYGR111W 1203 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YGR219WYGR219W 342 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 VTH1YIL173W 4650 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 VTH2YJL222W 4650 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MTD1YKR080W 963 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 YOR238WYOR238W 912 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 FEX1YOR390W 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 CIN2YPL241C 807 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 FEX2YPL279C 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 snR32snR32 188 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 VPS72YDR485C 2388 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 MTH1YDR277C 1302 nt5.22□□□□□ -1.57
HCM1P25364 GEP3YOR205C 1671 nt5.21□□□□□ -1.57
HCM1P25364 DAS2YDR020C 699 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YDR133CYDR133C 336 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 UBC6YER100W 753 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SFH5YJL145W 885 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YLR124WYLR124W 345 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 GSP1YLR293C 660 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YIM1YMR152W 1098 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YPL073CYPL073C 486 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YPL261CYPL261C 309 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YPR015CYPR015C 744 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YBR287WYBR287W 1284 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SPS2YDR522C 1509 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SSK1YLR006C 2139 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 CIK1YMR198W 1785 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SMF2YHR050W 1650 nt5.21□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SNZ3YFL059W 897 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 DSD1YGL196W 1287 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 ATG38YLR211C 681 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 CDC73YLR418C 1182 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 COS3YML132W 1140 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YMR085WYMR085W 1299 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YNL320WYNL320W 855 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SNZ2YNL333W 897 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 RDL2YOR286W 450 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 MUM2YBR057C 1101 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 HUT1YPL244C 1020 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 YPR195CYPR195C 330 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 BSD2YBR290W 966 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 COS2YBR302C 1140 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 ERT1YBR239C 1590 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 AIM10YER087W 1731 nt5.2□□□□□ -1.58
HCM1P25364 MSH1YHR120W 2880 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 IDP1YDL066W 1287 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SPR28YDR218C 1272 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 TLG1YDR468C 675 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 SIP2YGL208W 1248 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 FMP48YGR052W 1110 nt5.19□□□□□ -1.58
HCM1P25364 FOL2YGR267C 732 nt5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms