Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYF6P23409 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYF6P23409 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYF6P23409 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYF6P23409 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYF6P23409 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYF6P23409 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYF6P23409 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MYF6P23409 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYF6P23409 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYF6P23409 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MYF6P23409 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms