Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA6P23229 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms