Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX1P22670 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX1P22670 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX1P22670 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX1P22670 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX1P22670 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX1P22670 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFX1P22670 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RFX1P22670 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX1P22670 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX1P22670 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms