Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT1P21579 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT1P21579 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT1P21579 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT1P21579 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT1P21579 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT1P21579 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT1P21579 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT1P21579 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT1P21579 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT1P21579 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT1P21579 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT1P21579 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT1P21579 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms