Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms