Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP2B1P20020 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms