Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIG1P18858 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIG1P18858 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIG1P18858 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LIG1P18858 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIG1P18858 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIG1P18858 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIG1P18858 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIG1P18858 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIG1P18858 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIG1P18858 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIG1P18858 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIG1P18858 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIG1P18858 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIG1P18858 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIG1P18858 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIG1P18858 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LIG1P18858 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIG1P18858 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIG1P18858 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIG1P18858 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIG1P18858 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIG1P18858 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIG1P18858 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LIG1P18858 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIG1P18858 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIG1P18858 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIG1P18858 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LIG1P18858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIG1P18858 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms