Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NELFEP18615 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NELFEP18615 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NELFEP18615 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NELFEP18615 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NELFEP18615 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NELFEP18615 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NELFEP18615 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NELFEP18615 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NELFEP18615 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NELFEP18615 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NELFEP18615 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NELFEP18615 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NELFEP18615 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NELFEP18615 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NELFEP18615 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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