Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCP1P17987 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCP1P17987 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCP1P17987 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCP1P17987 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCP1P17987 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCP1P17987 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCP1P17987 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCP1P17987 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCP1P17987 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms