Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEBPBP17676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEBPBP17676 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms