Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYN1P17600 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYN1P17600 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYN1P17600 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYN1P17600 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYN1P17600 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYN1P17600 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYN1P17600 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYN1P17600 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYN1P17600 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYN1P17600 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYN1P17600 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYN1P17600 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYN1P17600 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYN1P17600 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms