Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2A2P16615 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms