Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPCAMP16422 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms