Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AREGP15514 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AREGP15514 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AREGP15514 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AREGP15514 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AREGP15514 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AREGP15514 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AREGP15514 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AREGP15514 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms