Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA3P15088 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPA3P15088 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPA3P15088 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPA3P15088 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA3P15088 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA3P15088 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA3P15088 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPA3P15088 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPA3P15088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms