Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB2P14652 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB2P14652 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms