Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLS3P13797 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLS3P13797 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLS3P13797 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLS3P13797 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLS3P13797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLS3P13797 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLS3P13797 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLS3P13797 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLS3P13797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLS3P13797 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms