Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT5P13647 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT5P13647 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT5P13647 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT5P13647 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT5P13647 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT5P13647 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT5P13647 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT5P13647 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT5P13647 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT5P13647 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT5P13647 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT5P13647 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT5P13647 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms