Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYGBP11216 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYGBP11216 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYGBP11216 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYGBP11216 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYGBP11216 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYGBP11216 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYGBP11216 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYGBP11216 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms