Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2CP0DJJ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms