Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms