Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSNP06396 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSNP06396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSNP06396 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSNP06396 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSNP06396 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSNP06396 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSNP06396 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSNP06396 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GSNP06396 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GSNP06396 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GSNP06396 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSNP06396 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSNP06396 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSNP06396 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSNP06396 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSNP06396 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSNP06396 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSNP06396 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms