Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCCBP05166 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCCBP05166 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCCBP05166 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCCBP05166 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCCBP05166 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCCBP05166 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCCBP05166 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCCBP05166 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCCBP05166 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCCBP05166 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCCBP05166 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCCBP05166 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCCBP05166 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCCBP05166 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCBP05166 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCBP05166 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCBP05166 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms