Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VTNP04004 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTNP04004 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTNP04004 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VTNP04004 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTNP04004 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTNP04004 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTNP04004 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTNP04004 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTNP04004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTNP04004 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTNP04004 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTNP04004 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTNP04004 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTNP04004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTNP04004 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTNP04004 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms