Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QAP02745 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QAP02745 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QAP02745 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QAP02745 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QAP02745 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QAP02745 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QAP02745 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QAP02745 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QAP02745 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QAP02745 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QAP02745 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QAP02745 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QAP02745 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QAP02745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QAP02745 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QAP02745 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QAP02745 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms