Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFP01133 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFP01133 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFP01133 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EGFP01133 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EGFP01133 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFP01133 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFP01133 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFP01133 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms