Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFDP00746 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFDP00746 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFDP00746 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFDP00746 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFDP00746 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFDP00746 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFDP00746 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFDP00746 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFDP00746 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFDP00746 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFDP00746 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFDP00746 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFDP00746 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFDP00746 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms