Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EGFRP00533 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EGFRP00533 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EGFRP00533 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EGFRP00533 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EGFRP00533 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EGFRP00533 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EGFRP00533 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EGFRP00533 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EGFRP00533 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EGFRP00533 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EGFRP00533 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EGFRP00533 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EGFRP00533 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EGFRP00533 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms