Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA3O96018 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA3O96018 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
APBA3O96018 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APBA3O96018 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA3O96018 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA3O96018 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA3O96018 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
APBA3O96018 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
APBA3O96018 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA3O96018 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms