Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD3O95983 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD3O95983 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD3O95983 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD3O95983 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MBD3O95983 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MBD3O95983 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MBD3O95983 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MBD3O95983 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD3O95983 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD3O95983 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD3O95983 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD3O95983 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD3O95983 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD3O95983 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD3O95983 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD3O95983 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD3O95983 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
MBD3O95983 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms