Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms