Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNTO95613 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNTO95613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNTO95613 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNTO95613 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNTO95613 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNTO95613 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNTO95613 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNTO95613 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNTO95613 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNTO95613 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNTO95613 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNTO95613 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNTO95613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNTO95613 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNTO95613 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNTO95613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNTO95613 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNTO95613 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms