Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM16O95361 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM16O95361 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms