Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms