Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE8BO95263 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms