Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM37O94972 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM37O94972 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM37O94972 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms