Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEBLO76041 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEBLO76041 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEBLO76041 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEBLO76041 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEBLO76041 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEBLO76041 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEBLO76041 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEBLO76041 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEBLO76041 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms