Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOO75962 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOO75962 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOO75962 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOO75962 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIOO75962 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIOO75962 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIOO75962 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIOO75962 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIOO75962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIOO75962 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms