Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGR5O75473 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGR5O75473 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGR5O75473 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGR5O75473 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR5O75473 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR5O75473 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR5O75473 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGR5O75473 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGR5O75473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGR5O75473 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LGR5O75473 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGR5O75473 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms