Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBNO60934 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBNO60934 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBNO60934 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBNO60934 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NBNO60934 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBNO60934 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBNO60934 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBNO60934 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NBNO60934 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms