Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF4O60810 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF4O60810 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms