Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms