Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX10O60683 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX10O60683 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX10O60683 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX10O60683 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX10O60683 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX10O60683 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX10O60683 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX10O60683 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX10O60683 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX10O60683 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX10O60683 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX10O60683 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PEX10O60683 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms